Grupo de Investigación en epigenómica y epigenética traslacional

Área de Metabolismo y Daño Orgánico

Profundizar en la caracterización de los mecanismos epigenéticos que otorgan variabilidad fenotípica en las enfermedades humanas, y que puedan dar lugar a biomarcadores de diagnóstico y pronóstico que puedan ser implementados en la medicina de precisión

Identificación de biomarcadores epigenéticos en sepsis y sepsis neonatal: predicción de la evolución clínica del paciente crítico así como a la predicción de morbilidades en los pacientes que sobreviven a una sepsis, apoyándonos para ello en biomarcadores basados en la metilación del ADN y los ARNs no codificantes

Coordinador
Dr. Jose Luis García Giménez
j.luis.garcia@uv.es

INVESTIGADORES
R4 Senior
R3 Consolidado

Jose Luis García Giménez    
Carmela Aguado Velasco
Nieves Carbonell Monleón
Salvador Mena Mollá

R2 Novel / Emergente
R1 Predoctoral

Jesús Beltrán García
Rebeca Osca Verdegal

STAFF
Colaborador/a
Enfermero/a
Técnico/a
Apoyo
Publicaciones
SARS-CoV-2 N-antigenemia in critically ill adult COVID-19 patients: frequency and association with inflammatory and tissue-damage biomarkers. Olea B, Albert E, Torres I, Gozalbo-Rovira R, Carbonell N, Ferreres J, Poujois S, Costa R, Colomina J, Rodriguez J, Blasco M, Navarro D. Journal of Medical Virology. 2022 Jan;94(1):222-228. doi: 10.1002/jmv.27300. PMID: 34449894

Clinical and immunological aspects of microRNAs in neonatal sepsis. Fatmi A, Chabni N, Cernada M, Vento M, Gonzalez-Lopez M, Aribi M, Pallardo FV, Garcia-Gimenez JL. Biomedicine & Pharmacotherapy. 2021 Nov 19;145:112444. doi: 10.1016/j.biopha.2021.112444. PMID: 34808550

Comparative analysis of chromatin-delivered biomarkers in the monitoring of sepsis and septic shock: a pilot study. Beltran-Garcia J, Manclus J, Garcia-Lopez E, Carbonell N, Ferreres J, Rodriguez-Gimillo M, Garces C, Pallardo F, Garcia-Gimenez J, Montoya A, Roma-Mateo C. International Journal of Molecular Sciences. 2021 Sep 14;22(18):9935. doi: 10.3390/ijms22189935. PMID: 34576097

DNA Methylation Analysis to Unravel Altered Genetic Pathways Underlying Early Onset and Late Onset Neonatal Sepsis. A Pilot Study. Lorente-Pozo S, Navarrete P, Garzón MJ, Lara-Cantón I, Beltrán-García J, Osca-Verdegal R, Mena-Mollá S, García-López E, Vento M, Pallardó FV, García-Giménez JL. Frontiers in Immunology. 2021 Feb 15;12:622599. doi: 10.3389/fimmu.2021.622599. PMID: 33659006

Implementing Precision Medicine in Human Frailty through Epigenetic Biomarkers. Garcia-Gimenez J, Mena-Molla S, Tarazona-Santabalbina F, Vina J, Gomez-Cabrera M, Pallardo F. International Journal of Environmental Research and Public Health. 2021 Feb 15;18(4):1883. doi: 10.3390/ijerph18041883. PMID: 33672064

Lower respiratory tract and plasma SARS-CoV-2 RNA load in critically ill adult COVID-19 patients: Relationship with biomarkers of disease severity. Olea B, Albert E, Torres I, Gozalbo-Rovira R, Carbonell N, Ferreres J, Poujois S, Costa R, Colomina J, Rodriguez J, Blasco M, Navarro D. Journal of Infection. 2021 Sep;83(3):381-412. doi: 10.1016/j.jinf.2021.05.036. PMID: 34087349

MicroRNA-185-5p: a marker of brain-sparing in foetuses with late-onset growth restriction. Morales-Rosello J, Loscalzo G, Garcia-Lopez EM, Ibanez Cabellos JS, Garcia-Gimenez JL, Canada Martinez AJ, Perales Marin A. Epigenetics. 2021 Dec 30;1-12. doi: 10.1080/15592294.2021.2023271. PMID: 34969362

Oxidative stress and rare diseases: from molecular crossroads to therapeutic avenues. Roma-Mateo C, Garcia-Gimenez J. Antioxidants. 2021 Apr 16;10(4):617. doi: 10.3390/antiox10040617. PMID: 33923815

Oxidative stress-mediated alterations in histone post-translational modifications. Garcia-Gimenez J, Garces C, Roma-Mateo C, Pallardo F. Free Radical Biology & Medicine. 2021 Jul;170:6-18. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2021.02.027. PMID: 33689846

Role of microRNAs as biomarkers in sepsis-associated encephalopathy. Osca-Verdegal R, Beltran-Garcia J, Pallardo FV, Garcia-Gimenez JL. Molecular Neurobiology. 2021 Sep;58(9):4682-4693. doi: 10.1007/s12035-021-02445-3. PMID: 34160774

Role of non-coding RNAs as biomarkers of deleterious cardiovascular effects in sepsis. Beltran Garcia J, Osca Verdegal R, Nacher Sendra E, Cardona Monzonis A, Sanchis Gomar F, Carbonell N, Pallardo FV, Lavie CJ, Garcia Gimenez JL. Progress in Cardiovascular Diseases. 2021;68:70-77. doi: 10.1016/j.pcad.2021.07.005. PMID: 34265333

The evolution of the ventilatory ratio is a prognostic factor in mechanically ventilated COVID-19 ARDS patients. Torres A, Motos A, Riera J, Fernandez-Barat L, Ceccato A, Perez-Arnal R, Garcia-Gasulla D, Penuelas O, Lorente J, Rodriguez A, de Gonzalo-Calvol D, Almansa R, Gabarrus A, Menendez R, Bermejo-Martin J, Ferrer R, Villar R, Anon J, Barbera C, Barberan J, Ortiz A, Bustamante-Munguira E, Caballero J, Carbajales C, Carbonell N, Catalan-Gonzalez M, Galban C, Gumucio-Sanguino V, de la Torre M, Diaz E, Estella A, Gallego E, Garmendia J, Garnacho-Montero J, Gomez J, Huerta A, Garcia R, Loza-Vazquez A, Marin-Corral J, de la Gandara A, Varela I, Messa J, Albaiceta G, Novo M, Penasco Y, Pozo-Laderas J, Ricart P, Salvador-Ade I, Sanchez-Miralles A, chinesta S, Socias L, Sole-Violan J, Sipmann F, Lomas L, Trenado J, Barbe F, CIBERESUCICOVID Project Cov20 0011, ISCIII. Critical Care. 2021 Sep 13;25(1):331. doi: 10.1186/s13054-021-03727-x. PMID: 34517881

Acute depletion of telomerase components DKC1 and NOP10 induces oxidative stress and disrupts ribosomal biogenesis via NPM1 and activation of the P53 pathway. Ibañez Cabellos S, Seco Cervera M, Picher Latorre C, Pérez Machado G, Garcia Gimenez J, Pallardo Calatayud F. Biochimica Et Biophysica Acta-Molecular. Cell Research. 2020 Dec;1867(12):118845. doi: 10.1016/j.bbamcr.2020.118845. PMID: 32910990

Circular RNAs in Sepsis: Biogenesis, Function, and Clinical Significance. Beltrán García J, Osca Verdegal R, Nacher-Sendra E, Pallardo Calatayud F, Garcia Gimenez J. Cells. 2020 Jun 25;9(6):1544. doi: 10.3390/cells9061544. PMID: 32630422

Circulating miRNA expression analysis reveals new potential biomarkers for human cutaneous melanoma staging. Sanchez Sendra B, Garcia Gimenez J, González Muñoz J, Navarro Cerveró L, Murgui A, Terradez Mas L, Pinazo Canales M, Martin Hernandez J, Monteagudo Castro C. Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology. 2020 Mar;34(3):e126-e129. doi: 10.1111/jdv.16060. PMID: 31710393

Cofilin dysregulation alters actin turnover in frataxin-deficient neurons. Muñoz Lasso D, Molla B, Calap Quintana P, Garcia Gimenez J, Pallardo Calatayud F, Palau F, González Cabo P. Scientific Reports. 2020 Mar 23;10(1):5207. doi: 10.1038/s41598-020-62050-7. PMID: 32251310

Correction to: miRNA-23b as a biomarker of culture-positive neonatal sepsis. Fatmi A, Rebiahi S, Chabni N, Zerrouki H, Azzaoui H, Elhabiri Y, Benmansour S, Ibanez-Cabellos J, Smahi M, Aribi M, Garcia-Gimenez J, Pallardo F. Molecular Medicine. 2020 Dec 14;26(1):129. doi: 10.1186/s10020-020-00257-0. PMID: 33317443

Epigenetic biomarkers for human sepsis and septic shock: insights from immunosuppression. Beltrán García J, Osca-Verdegal R, Roma Mateo C, Carbonell Monleon N, Ferreres Franco J, Rodriguez M, Mulet Mascarell S, Garcia-Lopez E, Pallardo Calatayud F, Garcia Gimenez J. Epigenomics. 2020 Apr;12(7):617-646. doi: 10.2217/epi-2019-0329. PMID: 32396480

From genetics to epigenetics to unravel the etiology of adolescent idiopathic scoliosis. Perez-Machado G, Berenguer-Pascual E, Bovea-Marco M, Rubio-Belmar P, Garcia-Lopez E, Garzon M, Mena Molla S, Pallardo Calatayud F, Bas T, Viña Ribes J, Garcia Gimenez J. Bone. 2020 Nov;140:115563. doi: 10.1016/j.bone.2020.115563. PMID: 32768685

Impact of periodontal treatment on the RANKL/OPG ratio in crevicular fluid. López Roldán A, Garcia Gimenez J, Alpiste Illueca F. PLoS One. 2020 Jan 27;15(1):e0227757. doi: 10.1371/journal.pone.0227757. PMID: 31986169

MicroRNA-148b-3p and MicroRNA-25-3p Are Overexpressed in Fetuses with Late-Onset Fetal Growth Restriction. Morales-Rosello J, Garcia Gimenez J, Martinez Priego L, Gonzalez-Rodriguez D, Mena Molla S, Maquieira Catala A, Loscalzo G, Buongiorno S, Jakaite V, Canada Martinez A, Perales Marin A. Fetal Diagnosis and Therapy. 2020;47(9):665-674. doi: 10.1159/000507619. PMID: 32585676

miRNA-23b as a biomarker of culture-positive neonatal sepsis. Fatmi A, Rebiahi S, Chabni N, Zerrouki H, Azzaoui H, Elhabiri Y, Benmassour S, Ibañez Cabellos S, Smahi M, Aribi M, Garcia Gimenez J, Pallardo Calatayud F. Molecular medicine. 2020 Oct 8;26(1):94. doi: 10.1186/s10020-020-00217-8. PMID: 33032520

Non-coding RNAs and Coronary Artery Disease. Cardona-Monzonis A, Garcia Gimenez J, Mena Molla S, Pareja Galeano H, De La Guia-Galipienso F, Lippi G, Pallardo Calatayud F, Sanchis Gomar F. Advances in Experimental Medicine and Biology. 2020;1229:273-285. doi: 10.1007/978-981-15-1671-9_16. PMID: 32285418

Oxidative Stress and Inflammation in COVID-19-Associated Sepsis: The Potential Role of Anti-Oxidant Therapy in Avoiding Disease Progression. Beltrán García J, Osca Verdegal R, Pallardo Calatayud F, Ferreres Franco J, Rodríguez González M, Mulet Mascarell S, Sanchis Gomar F, Carbonell Monleon N, Garcia Gimenez J. Antioxidants (Basel, Switzerland). 2020 Sep 29;9(10):936. doi: 10.3390/antiox9100936. PMID: 33003552

Oxygen in the neonatal period: Oxidative stress, oxygen load and epigenetic changes. Lorente-Pozo S, Parra-Llorca A, Lara-Canton I, Solaz A, Garcia Gimenez J, Pallardo Calatayud F, Vento M. Seminars in Fetal & Neonatal Medicine. 2020 Apr;25(2):101090. doi: 10.1016/j.siny.2020.101090. PMID: 32014366

Reactive Glia-Derived Neuroinflammation: a Novel Hallmark in Lafora Progressive Myoclonus Epilepsy That Progresses with Age. Lahuerta M, Gonzalez D, Aguado C, Fathinajafabadi A, Garcia Gimenez J, Moreno-Estelles M, Roma Mateo C, Knecht E, Pallardo Calatayud F, Sanz P. Molecular Neurobiology. 2020 Mar;57(3):1607-1621. doi: 10.1007/s12035-019-01842-z. PMID: 31808062

Sepsis and Coronavirus Disease 2019: Common Features and Anti-Inflammatory Therapeutic Approaches. Beltrán García J, Osca Verdegal R, Pallardo Calatayud F, Ferreres Franco J, Rodríguez González M, Mulet Mascarell S, Ferrando Sánchez C, Carbonell Monleon N, Garcia Gimenez J. Critical Care Medicine. 2020 Aug 18;10.1097/CCM.0000000000004625. doi: 10.1097/CCM.0000000000004625. PMID: 32826431

Thioredoxin and Glutaredoxin Systems as Potential Targets for the Development of New Treatments in Friedreich’s Ataxia. Seco-Cervera M, Gonzalez-Cabo P, Pallardo F, Roma-Mateo C, Garcia-Gimenez J. Antioxidants. 2020 Dec 10;9(12):E1257. doi: 10.3390/antiox9121257. PMID: 33321938

Proyectos
Referencia: DTS21/00193
Título: Test basados en péptidos spike-in y espectrometría de masas para la cuantificación de histonas circulantes y proteína APC, para el manejo clínico del paciente crítico
Entidad Financiadora: Instituto de Salud Carlos III – Cofinanciado FEDER
Investigador principal: Jose Luis García Giménez
Duración: 2022 – 2023
Presupuesto: 122.100 €

Referencia: 3819-21
Título: Valorización e internacionalización de HistShock, un test IVD para el diagnóstico y pronóstico de la sepsis y el shock séptico
Entidad Financiadora: Fundación para la Innovación y Prospectiva en Salud en España (FIPSE)
Investigador principal: José Luis García Giménez
Duración: 2021 – 2021
Presupuesto: 30.000 €

Referencia:
Título: Identificación de biomarcadores mediante el uso de las ómicas y la Inteligencia Artifical para el diagnóstico y el pronóstico de la sepsis neonatal
Entidad Financiadora: Fundación Mutua Madrileña
Investigador principal: Jose Luis García Giménez
Duración: 2020 – 2023
Presupuesto: 100.000 €

Referencia: INNVA1/2020/85
Título: Valorización, estrategia de protección y transferencia de un método de diagnóstico y pronóstico de la sepsis y el shock séptico
Entidad Financiadora: Agencia Valenciana de la Innovación-AVI Generalitat Valenciana
Investigador principal: Jose Luis García Giménez
Duración: 2020 – 2021
Presupuesto: 110.670 €

Referencia: PI19/00994
Título: Biomarcadores epigenéticos en sepsis y su implicación en inmunosupresión y futuras comorbilidades en supervivientes
Entidad Financiadora: Instituto de Salud Carlos III – Cofinanciado FEDER
Investigador principal: José Luis García Giménez
Duración: 2020 – 2022
Presupuesto: 111.320 €

Referencia: ACCI-2018
Título: Validación de biomarcadores para el diagnóstico y el pronóstico de la sepsis neonatal
Entidad Financiadora: CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER-ISCIII)
Investigador principal: José Luis García Giménez
Duración: 2019 – 2020
Presupuesto: 49.500 €

Referencia: PI16/01036
Título: Epigenética e inmunosupresión. Uso de las histonas circulantes y sus modificaciones posttraduccionales como biomarcadores de diagnóstico y pronóstico en sepsis y shock séptico
Entidad Financiadora: Instituto de Salud Carlos III – Cofinanciado FEDER
Investigador principal: José Luis García Giménez
Duración: 2017 – 2019
Presupuesto: 87.725 €

+ Información
Título: Búsqueda de MIARNS en fluido crevicular gingival: expresión diferencial en sujetos con periodontitis crónica avanzada
Doctorando: Almiñana Pastor, Pedro José
Director: Garcia Gimenez, José Luis; Bagan Sebastian, Jose Vicente; López Roldán, Andrés
Fecha: 04/03/2021
Universidad: Universitat de València

Título: Influencia de factores epigeneticos en el desarrollo de la escoliosis idiopatica del adolescente
Doctorando: Rubio Belmar, Pedro Antonio
Director: Bas Hermida, Teresa; García Giménez, José Luis
Fecha: 27/05/2021
Universidad: Universitat de València